GeXpert: Proyecto Desarrollo de Software de Biotecnología

Pantalla de Carga de GeXpert (español)

Proyecto de desarrollo de software open source de biotecnología para el apoyo de investigaciones científicas centradas en el descubrimiento y reconstrucción de vías metabólicas en el código genético de organismos ya secuenciados: GeXpert. Este proyecto fue presentado por primera vez en el marco de la XIV Feria de Software durante el 20 y 21 de Octubre del 2005 en Valparaíso, Chile.

Su primera prueba con datos reales fue realizada sobre la Burkholderia Xenovarans o LB400, que fueron proporcionados y validados por el Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología Ambiental de la UTFSM.

Fue implementado con tecnologías basadas en Java/JEE (extendiendo el RCP de Eclipse con diseño centrado en el usuario), con uso de librerías asociadas a: mapeo 2D/3D, reportes, parsing, biotecnología (BLAST, KEGG y NCBI) y con el motor de base de base de datos objetual (Ozone), a cargo de un equipo de 4 desarrolladores a medio tiempo. Liberado bajo licencia BSD, permitiendo realizar memorias de pregrado, publicaciones (nacionales e internacionales), presentaciones en conferencias y desarrollo de proyectos de investigación asociada.

GeXpert Splash Screen (english)

GeXpert fue presentado bajo el marco académico del plan de cuarto año de Ingeniería Civil Informática del Departamento de Informática, de la Universidad Técnica Federico Santa María. Este proceso dura un año académico (2 semestres), con un tiempo calendario aproximado de 8 meses. En esta instancia se crea una pre-empresa de desarrollo de un proyecto de desarrollo de software con un cliente real, el cual es sometido a una evaluación de un jurado y a una serie de exigencias y cumplimiento de hitos (entregables) a través de ambos semestres, culminando con la exposición abierta al público durante el evento llamado Feria de Software..

Datos Técnicos:

• Duración: 8 meses (Marzo a Octubre 2005).
• Tamaño Código: 23,5 KLOC.
• Desarrolladores: 4.
• Felipe Calderón Baeza.
• Diego Candel Contardo.
• Freddy Muñoz Ramírez.
• Jorge Avarias Alfaro.

Pre-Empresa: CellCore Soft.
Sitio Web Lanzamiento: http://www.feriadesoftware.cl/~cellcore (sitio web no vigente).